Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NficP70255 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NficP70255 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NficP70255 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NficP70255 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NficP70255 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NficP70255 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NficP70255 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms