Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms