Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pfn1P62962 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfn1P62962 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfn1P62962 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfn1P62962 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfn1P62962 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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