Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms