Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PlnP61014 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
PlnP61014 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms