Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms