Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CgnP59242 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CgnP59242 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CgnP59242 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CgnP59242 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms