Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P58686 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P58686 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P58686 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms