Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms