Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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