Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dpf3P58269 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dpf3P58269 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dpf3P58269 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dpf3P58269 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dpf3P58269 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dpf3P58269 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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