Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms