Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nub1P54729 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nub1P54729 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms