Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms