Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SqleP52019 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SqleP52019 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SqleP52019 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SqleP52019 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SqleP52019 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SqleP52019 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SqleP52019 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SqleP52019 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SqleP52019 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SqleP52019 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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