Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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