Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf19aP50636 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf19aP50636 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf19aP50636 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf19aP50636 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf19aP50636 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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