Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms