Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms