Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VdrP48281 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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