Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd4P46935 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd4P46935 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms