Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms