Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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