Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Saa4P31532 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms