Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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