Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx2P30658 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms