Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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