Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrbP28704 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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