Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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