Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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