Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NdnP25233 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NdnP25233 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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NdnP25233 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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NdnP25233 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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NdnP25233 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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NdnP25233 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NdnP25233 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NdnP25233 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NdnP25233 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NdnP25233 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NdnP25233 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NdnP25233 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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