Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd12P23812 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms