Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms