Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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