Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms