Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifrd1P19182 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms