Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms