Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LdhbP16125 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms