Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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DmdP11531 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DmdP11531 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms