Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tnp1P10856 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms