Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprqP0C5E4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms