Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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