Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01811 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01811 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01811 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01811 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01811 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms