Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01789 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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P01789 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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