Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01665 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01665 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01665 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms