Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mtatp6P00848 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms