Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms