Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlkO54988 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlkO54988 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlkO54988 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlkO54988 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlkO54988 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlkO54988 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlkO54988 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms