Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms