Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CrxO54751 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms